جهاد دانشگاهی-پژوهشکده توسعه صنایع شیمیایی ایران نشریه شیمی و مهندسی شیمی ایران 1022-7768 41 3 2022 11 22 Experimental and computational studies of thiolation of oligonucleotide towards its stabilizing on the surface of silver nanoparticles مطالعات آزمایشگاهی و محاسباتی تیول‏دار کردن الیگونوکلئوتید به منظور نشاندن آن روی سطح نانوذره های نقره 1 11 242821 FA الهه عالی دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائمشهر ، قائمشهر، ایران علی شکوهی راد دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائمشهر ، قائمشهر، ایران مهری اصفهانیان دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائمشهر ، قائمشهر، ایران Journal Article 2020 05 28 In this study, a specific sequence of oligonucleotides was attached to silver nanoparticles after thiolization in a saline medium. Investigation of this bond was performed using ultraviolet-visible spectroscopy (UV_Vis spectroscopy) by changing the silver nanoparticles' wavelength and thiol oligonucleotide attached to silver nanoparticles. Also, by bond transfer in polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) due to the increase in molecular weight after binding silver nanoparticles to a thiolated oligonucleotide, this bond's accuracy has been investigated. To find the bonds' electronic structure and stability, DFT studies have been performed using the Gaussian 09 program, aiming to see the optimal conditions for the binding of thiolated oligonucleotides to silver nanoparticles. In general, the binding of silver nanoparticles to thiolated oligonucleotides makes the specific adsorption of the sequence to the cell more targeted. Also, it increases the accuracy, precision, and specificity of adsorption. Calculations showed the absorption energy of -54.4 kJ / mol, the transfer of electric charge of 0.129 e after binding the thiolated oligonucleotide to silver nanoparticles, indicating a useful connection between them. در این مطالعه یک توالی خاص از الیگونوکلئوتید پس از تیول دار شدن در محیط نمکی به نانوذره های نقره متصل شده است. بررسی این اتصال با استفاده از طیف سنجی مرئی ـ فرا بنفش (طیف سنجی UV_Vis) با تغییر در طول موج حاصل از نانوذره های نقره و الیگونوکلئوتید تیول‎دار متصل به نانوذره های نقره انجام شده است. همچنین با جابجایی باند در الکتروفورز ژل پلی‎آکریل آمید (PAGE) به دلیل افزایش وزن مولکولی پس از اتصال نانوذره های نقره به الیگونوکلئوتید تیول‎دار نیز صحت این اتصال بررسی شده است. به منظور یافتن ساختار الکترونیکی و پایداری اتصال ها، مطالعات DFT با استفاده از برنامه گوسین 09 انجام شده است، که هدف آن یافتن شرایط بهینه برای اتصال الیگونوکلئوتید تیولدار به نانوذره های نقره می باشد. در کل، اتصال نانوذره های نقره به الیگونوکلئوتید تیولدار باعث هدفمندتر شدن جذب اختصاصی سکانس به سلول می شود و همچنین دقت، صحت و اختصاصیت جذب را افزایش می دهد. محاسبات میزان انرژی جذب kJ/mol 8/54-، جابجایی بار الکتریکی e 129/0را پس از اتصال الیگونوکلئوتید تیول‎دار به نانوذره های نقره نشان داد که بیان کننده از اتصال موثر بین آنها می باشد.

https://www.nsmsi.ir/article_242821_0b38550c442c6901d2042ba298256c42.pdf